Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cfap46E9Q2C0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cfap46E9Q2C0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms