Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Myo5cE9Q1F5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo5cE9Q1F5 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms