Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms