Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brd1E9PZ26 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms