Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sfta2E9PXB6 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms