Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms