Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms