Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrc5C3VPR6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc5C3VPR6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms