Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud7bB2RUR8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms