Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apba1B2RUJ5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms