Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

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Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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PtprbB2RU80 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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PtprbB2RU80 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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PtprbB2RU80 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PtprbB2RU80 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PtprbB2RU80 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PtprbB2RU80 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PtprbB2RU80 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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