Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrt4B2RU40 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms