Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms