Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Zbed5B2RPU8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Zbed5B2RPU8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Zbed5B2RPU8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms