Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CK137956B1AYM9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms