Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms