Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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Spocd1B1ASB6 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Spocd1B1ASB6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms