Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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