Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm6880A3KG45 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm6880A3KG45 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm6880A3KG45 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm6880A3KG45 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm6880A3KG45 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm6880A3KG45 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm6880A3KG45 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm6880A3KG45 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gm6880A3KG45 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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