Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttll9A2APC3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms