Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cavin4A2AMM0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cavin4A2AMM0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cavin4A2AMM0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cavin4A2AMM0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cavin4A2AMM0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cavin4A2AMM0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cavin4A2AMM0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cavin4A2AMM0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cavin4A2AMM0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cavin4A2AMM0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cavin4A2AMM0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cavin4A2AMM0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cavin4A2AMM0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms