Protein–RNA interactions for Protein: A2AD83

Frmd7, FERM domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd7A2AD83 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmd7A2AD83 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms