Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms