Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms