Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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