Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt27Q9Z320 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms