Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer1Q9Z2Y3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms