Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V4

Pck1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pck1Q9Z2V4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Pck1Q9Z2V4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Pck1Q9Z2V4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Pck1Q9Z2V4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pck1Q9Z2V4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pck1Q9Z2V4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pck1Q9Z2V4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pck1Q9Z2V4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms