Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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