Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms