Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms