Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd3Q9Z2D8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms