Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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RfxankQ9Z205 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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