Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip6Q9Z1Y4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms