Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms