Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms