Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms