Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms