Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms