Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms