Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Nphs1Q9QZS7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Nphs1Q9QZS7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nphs1Q9QZS7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nphs1Q9QZS7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nphs1Q9QZS7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphs1Q9QZS7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms