Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms