Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc3Q9QZC1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc3Q9QZC1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc3Q9QZC1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms