Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Six6Q9QZ28 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Six6Q9QZ28 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
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