Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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