Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc5Q9QX29 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms