Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc42ep4Q9JM96 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms