Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Tmod4Q9JLH8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Tmod4Q9JLH8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Tmod4Q9JLH8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Tmod4Q9JLH8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Tmod4Q9JLH8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Tmod4Q9JLH8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod4Q9JLH8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms