Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tlr5Q9JLF7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tlr5Q9JLF7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tlr5Q9JLF7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tlr5Q9JLF7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms