Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Arl6ip1Q9JKW0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms